安徽桃花源自成立之初，就高起点、全方位开展水稻品种研发与创新，大力进行科研平台建设。
        公司投入300多万元购买检验和实验相关设备，建设了规模与实力兼具的分子检验室。具备常规检验和分子检测功能，可为公司产品建立指纹档案数据，又能对科研材料的选择和育种亲本材料辅选起到了精准高效、压缩规模、减少世代降低成本的作用，同时对有效凝聚和整合科技资源，发挥创新平台和增长引擎功能做好了准备。
       常规检验室配备了粉碎机、烘箱、净度分析台、发芽箱、天子天平等专业设备，可以承担种子的常规检测，完成国家规定的品种净度、水分、芽率、纯度四项指标外，还可以对品种的真实性和种子活力进行检验。
       分子实验室配置有高压灭菌锅、超纯水仪、制冰机、PH仪、高速冷冻离心机、PCR仪、核算蛋白分析仪、毛细管电泳仪、凝胶电泳仪等专业先进设备。可以完成样品接收到DNA提取到DNA体外扩增到数据分析等分子检测的一整套流程。分子检测有常规的PAGE胶系统和高档的毛细管电泳系统，可以帮助公司进行的纯度和真实性鉴定的同时，还可以帮助科研人员进行分子标记辅助选择育种加速公司育种进程。
      2019年，安徽桃花源还建设完成了科研冷灌池，即：两系人工智能低温胁迫筛选系统设施，为公司科研育种进一步提供了硬件和软件保障。
      安徽桃花源分子实验室未来规划从分子设计育种、CRISPR/Cas编辑育种、多倍体育种等三大方面进行科研设计和研究。